OncoNext
Onconext, tamamen onkolojiye adanmış yeni Genoma Group bölümüdür. Bu bölüm, solid tümörlerin incelenmesine uygulanan moleküler biyoloji ve genetik alanında uzmanlaşmış multidisipliner bir profesyonel ekibinden oluşmaktadır. Onconext testleri, kan veya doku biyopsisi örneğinden somatik ve germinal mutasyonları tespit etmek amacıyla planlanmıştır.
Kalıtsal solid tümörlerle ilgili germinal mutasyonların önleyici amaçlarla incelenmesinin yıllar içinde tanıtılması, yalnızca potansiyel patolojilerin prognozunu kişiselleştirilmiş izleme programlarıyla iyileştirmekle kalmamış, aynı zamanda ihtiyaç duyulması halinde hedefe yönelik farmakolojik tedavilerin yönetiminde de hastaların tedavi süreçlerini geliştirmeye olanak sağlamıştır.
Onkolojide somatik mutasyonların varlığını belirlemek için moleküler biyolojinin sağlam kullanımı, ayrıca insan ilişkisini hasta ile merkezileştirmeyi ve kişinin ihtiyaçlarını daha fazla karşılamayı mümkün kılmış, “akıllı ilaçlar” geliştirilmesi ve uygulanması yoluyla kişisel tedavi yöntemlerini artırmıştır.
ONCONEXT RISK™, Genoma Group’un, bireyin tüm hücrelerinde bulunan ve nesillere aktarılabilir olan germ hattı mutasyonlarının incelenmesine adanmış testlerini içerir. Bu mutasyonların kalıtsal tümör gelişiminde rol oynadığına inanılmaktadır.
İncelenen mutasyonlar, tümör baskılayıcı proteinleri kodlayan genlerde lokalize olan mutasyonlardır (hücre çoğalmasının negatif kontrolü, DNA onarımı ve apoptoz regülasyonu) ve bu mutasyonlar biyolojik işlevlerini sınırlayarak tümör baskılayıcı aktiviteleri kısıtlar.
Bu mutasyonları taşıyan bireylerin, tümör patolojileri geliştirme konusunda daha yüksek bir yatkınlığa sahip oldukları bilinmektedir.
Günlük olarak maruz kalınan mutajenik faktörler nedeniyle, tümör baskılama aktiviteleri genel popülasyona göre daha fazla tehlikeye girebilir ve proto-onkogenlerden türeyen potansiyel tümör baskılayıcı genlerin (hücre döngüsü ilerlemesi ve hücre proliferasyonu işlevi) mutajenik ajanlara maruz kalma sonucunda serbestçe faaliyet göstermesine olanak tanır.
OncoNext® Risk - Breast ile ilgili NGS taraması (13 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, PALB2, RAD51C, RAD51D, STK11, TP53, PTEN
OncoNext® Risk – Colon ile ilgili NGS taraması (19 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
APC, BMPR1A, CDH1, EPCAM, GREM1, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, PMS2, PIK3CA, POLD1, PTEN, SMAD4, STK11, TP53, KRAS, PMS1, TGFBR2
OncoNext® Risk – Gastric ile ilgili NGS taraması (11 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
APC, BMPR1A, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, STK11, SMAD4, TP53, CTNNA1
OncoNext® Risk – Melanoma ile ilgili NGS taraması (8 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
BAP1, BRCA2, CDK4, CDKN2A, MITF, PTEN, RB1, TP53
OncoNext® Risk - Oncoscreening Complete ile ilgili NGS taraması (82 gen) (Test sonuçlanması: 30 gün, Numune türü: EDTA tüp)
AIP, APC, ATM, BAP1, BARD1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDC73, CDH1, CDK4, CDKN1B, CDKN2A, CEBPA, CHEK2, DICER1, EGFR, EPCAM, EXT1, EXT2, FH, FLCN, GALNT12, GATA2, GPC3, GREM1, HOXB13, HRAS, KIT, MAX, MEN1, MET, MITF, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NF2, NSD1, PALB2, PHOX2B, PMS1, PMS2, POLD1, PRF1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, RB1, RET, RHBDF2, RUNX1, SBDS, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SMAD4, SMARCA4, SMARCB1, SMARCE1, STK11, SUFU, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, VHL, WT, CTNNA1, PDGFRA, PIK3CA, KRAS, TGFR2
OncoNext® Risk – Ovarian ile ilgili NGS taraması (15 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
BRCA1, BRCA2, BRIP1, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, STK11, CHEK2, ATM
OncoNext® Risk – Pancreas ile ilgili NGS taraması (14 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
ATM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, CHECK2, CDKN2A, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PALB2, PMS2, STK11, TP53
OncoNext® Risk – Prostate ile ilgili NGS taraması (13 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
ATM, BRCA1, BRCA2, CHEK2, EPCAM, HOXB13, MLH1, MSH2, MSH6, NBN, PALB2, TP53, PMS2
OncoNext® Risk – Thyroid ile ilgili NGS taraması (1 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
RET
OncoNext® Risk BRCA (BRCA1, BRCA2) ile ilgili NGS taraması (2 gen) (Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: EDTA tüp)
BRCA1, BRCA2
ONCONEXT LIQUID™ CNV testi, kanser hücrelerinin genomunda büyük kromozom bölümlerinin kazanımlarını ve kayıplarını (Kopya Sayısı Varyasyonları – CNV'ler) tespit etmek amacıyla, hastalardan alınan plazma örneğindeki dolaşımdaki tümör DNA'sını (ctDNA) analiz ederek yapılan, genom çapında yeni nesil dizileme (NGS) tabanlı bir testtir. Genom genelindeki CNV'lerin tanımlanması, kanser hücrelerinin karakteristik özelliklerinden biri olan genomik instabilitenin (Kopya Sayısı İstikrarsızlığı) bir sonucu olup, tümör varlığını veya ilerlemesini gösterir.
ONCONEXT LIQUID™ CNV testi, kemoterapi veya immünoterapi gören hastalar için tedavi takibi ve tümör rezeksiyonundan sonra nüks takibi için uygundur.
Genoma Group tarafından geliştirilen ONCONEXT LIQUID™ genetik testleri, dolaşımdaki tümör DNA'sının (ctDNA) periferik kanda incelenmesi amacıyla, onkolojik hastalarda veya yüksek risk altında olan kişilerde somatik mutasyonların incelenmesi için planlanmıştır.
ctDNA çalışması, aynı zamanda sıvı biyopsi olarak da adlandırılır ve bu, günümüzde onkologların kullanabileceği en yenilikçi araçtır. Onconext Liquid™ ile Genoma Group'un sunduğu sıvı biyopsi sayesinde, klinisyen onkolojik hastanın tanısını ve prognozunu doğru bir şekilde iyileştirebilir ve yüksek riskli bir hastada, zamanla önemli ölçüde değişiklik gösterirse, tümör odaklarının varlığına işaret edebilecek somatik mutasyonların varlığını tespit edebilir; bu teknoloji sayesinde, çok erken bir dönemde teşhis edilebilir.
Onconext Liquid™, patolojinin genomik profilini incelemek için ana DNA kaynağı ve ilk morfolojik/histolojik tanı için altın standart olarak kalan doku biyopsisinin yerini almaz, ancak elde edilen bilgileri doğrular ve derinleştirir.
Onconext Liquid™, ayrıca, geleneksel biyopsinin invazivlik özellikleri nedeniyle sınırlı kullanım bulduğu tüm durumlarda en iyi alternatif testtir.
Onconext® Liquid Breast(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
AKT1, EGFR, ERBB2, ERBB3, ESR1, SF3B1, KRAS e PIK3CA, FBXW7, TP53
Onconext® Liquid Colon(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
ALK, ROS1, RET, BRAF, KRAS, NRAS, NTRK1, EGFR, ERBB2, NTRK3, APC, TP53
Onconext® Liquid Gastric(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
ERBB2, NTRK1, NTRK3
Onconext® Liquid Lung(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
ALK, BRAF, EGFR, KRAS, MET, NRAS, RET, ROS1, ERBB2, NTRK1, NTRK3
Onconext® Liquid Thyroid(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
ALK, KRAS, NRAS, HRAS, BRAF, PIK3CA, CTNNB1, RET, NTRK1, NTRK3
Onconext® Liquid 50 genes(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
AKT1, EGFR ,FLT3, KRAS, PDGFRA, ALK, ERBB2, GNA11, MAP2K1, PIK3CA, AR, ERBB3 ,GNAQ, MAP2K2, RAF1, ARAF, ESR1, GNAS, MET, RET,BRAF, FGFR1, HRAS, MTOR , ROS1,CHEK2, FGFR2, IDH1, NRAS, SF3B1,CTNNB1,FGFR3, IDH2, NTRK1, SMAD4, DDR2, FGFR4, KIT, NTRK3, SMO. APC, FBXW7,PTEN,TP53, CCND1, CCND2, CCND3, CDK4, CDK6, MYC, ERG ,ETV1, RET
Onconext® Precision Liquid**(Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Streck tube):
DNA-based genomic profiling >523 genes with recurrent hotspot mutations 59 with focal acquisition or loss of CNVs 23 fusion genes 49 fusion driver genes, TMB
* include hot spots, CNVs and fusions.
** See Onconext® Precision Liquid Tab2 gene list.
Easilycare BLADDER: a test that evaluates the DNA methylation pattern of 15 biomarkers associated with urothelial carcinoma using a urine sample.
Signatera: the test measures circulating tumor DNA to detect and quantify residual tumor in the body (minimal residual disease).
ONCONEXT Tissue™ genetik testleri, doku biyopsi örneklerinde, solid tümörlerle ilgili somatik mutasyonları tespit etmek amacıyla onkolojik kullanım için planlanmıştır.
ONCONEXT Tissue™ genetik testleri, küçük miktarda tümör dokusundan bile somatik mutasyonların varlığını son derece hassas bir şekilde tespit etmeyi mümkün kılan yenilikçi Yeni Nesil Dizileme (NGS) teknolojisini kullanır.
Farklı mutasyonların aynı anda tespit edilmesi, tümörün genomik profilini daha iyi anlamayı ve en uygun tedaviyi uygulamayı sağlar.
ONCONEXT Tissue™ genetik testleri, onkolojik kullanım için, farklı klinik ve tanısal amaçlarla onkoloji hastaları için planlanmıştır:
- Doğru uygulama için tümör profillemesi: OncoNext Tissue™ Monitor, onkoloğa kişisel bir tedavi planı oluşturmak için faydalı bilgiler sağlayabilir.
- Prognostik bilgi sağlama
- Klinik deneye kabul için hasta desteği: OncoNext Tissue™ testinin ek bir işlevi olup, hastanın uygunluk kriterlerine girdiği belirli klinik denemeleri belirlemeyi amaçlar.
Onconext® Tissue Colon (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ALK, BRAF, ERBB2, KRAS, NRAS, RET, ROS1, EGFR, NTRK1, NTRK2, NTRK3
Onconext® Tissue Gastric (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ERBB2, NTRK1, NTRK3, NTRK2
Onconext® Tissue Lung (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, KRAS, MET, NRAS, RET, ROS1, NTRK1, NTRK2, NTRK3
Onconext® Tissue Pancreas (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ALK, FGFR2, KRAS, RET, ROS1, BRAF, NTRK1/2/3
Onconext® Tissue Ovary (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
POL-E, TP53, PIK3CA, PTEN
Onconext® Tissue Thyroid (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ALK, BRAF, CTNNB1, HRAS, KRAS, NRAS, PIK3CA, RET, NTRK1, NTRK2, NTRK3
Onconext® Tissue BRCA (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
BRCA1 and BRCA2
Onconext® Tissue BRCA panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
BRCA1, BRCA2 and HRR
HRR gene panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ATM, BARD1, BRIP1, CDK12, CHEK1, CHEK2, FANCD2, FANCL, MRE11, NBN, PALB2, POLD1, POLE, PPP2R2A, PTEN, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD52, RAD54L, TP53, XRCC2 + KRAS, PIK3CA
Microsatellite instability (MSI) (Bethesda Panel) (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
BAT-25, BAT-26, CAT-25, MONO-27, NR-21, NR-22, NR-24, NR-27
Lung First Level Panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
ALK, BRAF, EGFR, KRAS, MET, NTRK -1/2/3, RET, ROS1
BRAF Panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
BRAF V600-601
RAS Panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
KRAS, NRAS, HRAS
RAS + BRAF Panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
KRAS, NRAS, HRAS, BRAF (V600-601)
EGFR Panel (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
Major mutations
Onconext® Tissue 50 genes (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
AKT1,ALK,AR, BRAF, CDK4, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, KT1, CCND1, CDK6, FGFR4, MET, MYC, MYCN, PDGFRA, AKT3, AXL, ERG, ETV1, ETV4, ETV5, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PPARG, ROS1
Onconext® Precision Tissue** (Test yöntemi: NGS, Test sonuçlanması: 20 gün, Numune türü: Biyopsi materyali):
Genomic Profiling on DNA and RNA > 500 genes: 47 Fusion genes, TMB, 156 hot spots, 333 CNVs, BRCA1 and BRCA2, HRD, MSI, allowing for a measure of genomic instability, Genomic Instability Metric (GIM)
Single mutation or single gene analyses are also available
* include hot spots, CNVs and fusions.
**See Onconext® Precision Tissue Tab1
