Οδηγός για την Αλληλούχιση Ολόκληρου του Εξωμώματος (WES): Για ασθενείς και οικογένειες

Ο γιατρός ή ο γενετικός σύμβουλός σας μπορεί να σας πρότεινε να κάνετε εσείς ή κάποιο μέλος της οικογένειάς σας μια εξέταση που ονομάζεται Αλληλούχιση Ολόκληρου του Εξωμώματος (WES). Ο οδηγός αυτός έχει ετοιμαστεί για να σας βοηθήσει να μάθετε περισσότερα για την WES. Αν έχετε ερωτήσεις σχετικά με τις πληροφορίες αυτού του οδηγού, απευθυνθείτε στον γιατρό ή στον γενετικό σας σύμβουλο.

Γενετική

Σε όλους τους ανθρώπους, σχεδόν κάθε κύτταρο του σώματός μας περιέχει περίπου 20.000 γονίδια· κληρονομούμε τα μισά γονίδιά μας από τη μητέρα μας και τα άλλα μισά από τον πατέρα μας. Τα γονίδια είναι τα σχέδια (ή οι οδηγίες) που ελέγχουν τα πάντα στο σώμα μας, συμπεριλαμβανομένων της ανάπτυξης, της αύξησης και της υγείας μας.

Τα γονίδιά μας αποτελούνται από DNA (δεοξυριβονουκλεϊκό οξύ) και είναι οργανωμένα σε εξώνια και εσώνια. Τα εξώνια είναι οι κωδικοποιούσες περιοχές του γονιδίου· περιέχουν τις πληροφορίες που χρησιμοποιούνται για την παραγωγή των πρωτεϊνών που είναι απαραίτητες για τη φυσιολογική αύξηση, ανάπτυξη και λειτουργία των οργάνων. Τα εσώνια είναι οι μη κωδικοποιούσες περιοχές του γονιδίου και συνήθως περιέχουν σημαντικές πληροφορίες σχετικά με το πότε κατά την ανάπτυξη (για παράδειγμα, στα πρώτα στάδια της εγκυμοσύνης ή στην ενήλικη ζωή) και σε ποιο μέρος του σώματος (για παράδειγμα, στην καρδιά ή στον εγκέφαλο) πρέπει να χρησιμοποιείται ένα γονίδιο.

Το σύνολο των γενετικών μας πληροφοριών, συμπεριλαμβανομένων των εσωνίων και των εξωνίων, ονομάζεται γονιδίωμα. Τα εξώνια αποτελούν ένα πολύ μικρό μέρος των συνολικών γενετικών μας πληροφοριών (περίπου 1-2%). Το σύνολο μόνο των εξωνίων ονομάζεται εξώμα.

Το εξώμα κάθε ανθρώπου παρουσιάζει ορισμένες διαφορές σε σύγκριση με το εξώμα ενός άλλου ανθρώπου – αυτό μας κάνει όλους μοναδικούς! Ωστόσο, μερικές φορές μία ή περισσότερες γενετικές διαφορές, οι λεγόμενες γενετικές παραλλαγές, μπορεί να εμποδίζουν τη φυσιολογική λειτουργία ενός ή περισσότερων γονιδίων ή να τα κάνουν να λειτουργούν διαφορετικά από το αναμενόμενο. Σε αυτές τις περιπτώσεις, αυτές οι γενετικές παραλλαγές προκαλούν γενετικά νοσήματα.

Τι είναι η αλληλούχηση ολόκληρου του εξώματος;

Οι περισσότερες γενετικές παραλλαγές που προκαλούν γενετικά νοσήματα βρίσκονται στο εξώμα. Η WES είναι μια εξέταση που αναλύει, σε μία μόνο εξέταση, τις γενετικές πληροφορίες που περιέχονται στα 20.000 γονίδιά μας (και στα πολυάριθμα εξώνιά τους). Η WES δεν μπορεί να ανιχνεύσει αξιόπιστα τις μη κωδικοποιούσες περιοχές και τις επεκτάσεις επαναλήψεων· ένα αρνητικό αποτέλεσμα δεν αποκλείει γενετική αιτία. Αυτό τη διαφοροποιεί από άλλες γενετικές εξετάσεις, στις οποίες εξετάζεται μόνο ένα γονίδιο (ή λίγα γονίδια) κάθε φορά.

Η WES πραγματοποιείται με τη χρήση μιας ειδικής τεχνολογίας που ονομάζεται αλληλούχηση νέας γενιάς (NGS). Το DNA απομονώνεται από δείγμα αίματος ή σάλιου που λαμβάνεται από τον ασθενή. Στη συνέχεια, το DNA του ασθενούς συγκρίνεται με ένα δείγμα αναφοράς (ένα δείγμα που αντιπροσωπεύει τη «φυσιολογική» αλληλουχία του ανθρώπινου DNA) και εξετάζεται εάν υπάρχουν διαφορές μεταξύ του DNA του ασθενούς και του DNA αναφοράς. Εάν υπάρχουν διαφορές, αξιολογούνται από εξειδικευμένους εργαστηριακούς γενετιστές και ειδικούς ιατρούς.

Ποιοι πρέπει να υποβληθούν σε WES;

Η WES μπορεί να πραγματοποιηθεί κατά την εγκυμοσύνη, στην παιδική ηλικία ή στην ενήλικη ζωή. Κατά την εγκυμοσύνη, η WES πραγματοποιείται με γενετική συμβουλευτική όταν υπάρχει δομική ανωμαλία και ο καρυότυπος ή η ανάλυση μικροσυστοιχιών δεν έχουν δώσει διάγνωση. Η WES μπορεί να εντοπίσει παραλλαγές αβέβαιης σημασίας (VUS) και δευτερογενή ευρήματα· τα ευρήματα που θα γνωστοποιηθούν επιλέγονται στο έντυπο συγκατάθεσης πριν από την εξέταση, ενώ πρέπει να παρέχεται γενετική συμβουλευτική πριν και μετά την εξέταση. Συνήθως πραγματοποιείται για έναν ή περισσότερους από τους ακόλουθους λόγους:

1. Υπάρχει υποψία γενετικής πάθησης σε εσάς (ή στο παιδί σας)
2. Τα συμπτώματά σας (ή τα συμπτώματα του παιδιού σας) μπορεί να οφείλονται σε πολλά διαφορετικά γονίδια
3. Έχετε (ή το παιδί σας έχει) σύνθετο ιατρικό ιστορικό που επηρεάζει πολλά όργανα ή/και συστήματα του σώματος
4. Έχετε (ή το παιδί σας έχει) υποβληθεί στο παρελθόν σε γενετικές εξετάσεις, αλλά τα αποτελέσματα ήταν φυσιολογικά

Ποιοι δεν πρέπει να υποβληθούν σε WES;

Η WES ενδέχεται να μην είναι η ιδανική εξέταση εάν εσείς ή το παιδί σας έχετε μια πάθηση που είναι απίθανο να έχει γενετική αιτία ή εάν εσείς ή το παιδί σας έχετε μια γενετική πάθηση που είναι γνωστό ή πιθανολογείται ότι προκαλείται από ένα μόνο γονίδιο. Συζητήστε με τον ιατρό ή τον γενετικό σας σύμβουλο για να μάθετε ποια εξέταση είναι κατάλληλη για εσάς ή το παιδί σας.

Γιατί να επιλέξετε την Eurofins Biomnis;

1. Εξειδικευμένο εργαστήριο ιατρικής βιολογίας με 20 χρόνια εμπειρίας, Λυών, Γαλλία
2. Εξέταση διαπιστευμένη κατά ISO 15189
3. Άδεια διενέργειας εξετάσεων ιδιοσυστατικής γενετικής
4. Πιστοποιημένοι κλινικοί παθολογοανατόμοι, ειδικοί γενετιστές
5. Εξειδίκευση στις τεχνικές αλληλούχησης για διαγνωστικές εφαρμογές από το 2014
6. Το μοναδικό εργαστήριο που παρέχει ολοκληρωμένη λύση για τη WES χωρίς πρόσθετη χρέωση
7. Βιβλιοθήκη Twist, αλληλούχηση Illumina 2x150 Novaseq 6000. Απόδοση: # 98% στα 30x στο Refseq + 2 pb, ευαισθησία > 99% (η απόδοση ελέγχθηκε στο GiaB, στην περιοχή-στόχο refseq +/-20 pb με >15 Mo ζεύγη αναγνώσεων και κάλυψη 95% > 10X ). Ανάλυση εξώματος με διαπίστευση ISO 15189, ροή ανάλυσης CE-IVD, δεδομένα σε ασφαλή διακομιστή HPD.

Τα πάνελ WES μας·

1. Διευρυμένο ογκογενετικό πάνελ που περιλαμβάνει πάνελ μαστού/ωοθηκών και προστάτη, πεπτικού συστήματος, παγκρέατος, νεφρών, δέρματος, πνευμόνων και νευροενδοκρινών όγκων (75 γονίδια): ACD, APC, ATM, BAP1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, CDH1, CDK4, CDKN2A, CDKN2B, CHEK2, DLST, DNMT3A, EGFR, EGLN1, EGLN2, EPAS1, EPCAM, ERBB2, FH, FLCN, GOT2, HNF1B, HOXB13, LZTR1, MAX, MC1R, MDH2, MEN1, MERTK, MET, MITF, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NF2, PALB2, PBRM1, PMS2, POLD1, POLE, POT1, PRKN, PTCH1, PTCH2, PTEN, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RET, RTEL1, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SETD2, SLC25A11, SMAD4, SMARCB1, STK11, STN1, SUFU, TERF2IP, TERT, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, VHL, WT1.
2. WES (Αλληλούχηση ολόκληρου του εξώματος)

*Πατήστε εδώ για γενικές πληροφορίες σχετικά με την εξέταση WES.

**Πατήστε εδώ για πληροφορίες σχετικά με το γιατί να επιλέξετε το εργαστήριο Biomnis για την εξέταση WES.